図録 特別展 信長×信玄 戦国のうねりの中で (開館20周年記念)
図録 特別展 青銅の鐸と武器 近江の弥生時代とその周辺 (開館25周年記念)
水中考古学の世界 びわこ湖底の遺跡を掘る 第38回企画展図録
日は人作り、夜は神作る : 前方後円墳の出現と展開 : 平成十六年度春季特別展
琵琶湖と中世の人々 信長以前・信長以後 平成10年度秋季特別展
韓国より渡り来て : 古代国家の形成と渡来人 : 平成十三年度春季特別展
共に一女子を立て 卑弥呼政権の成立 開館10周年記念展・平成14年度春季特別展
是非に及ばず : 本能寺の変を考える : 平成13年度秋季特別展
信長と宗教勢力 保護・弾圧そして支配へ 平成15年度秋季特別展
信長の城・秀吉の城 : 織豊系城郭の成立と展開 : 平成18年度秋季特別展
[図録]日継知らす可き王無し : 継体大王の出現 : 平成15年度春季特別展
ムラの変貌 : 稲作と弥生文化 : 証される農耕集落 : 平成10年度春季特別展
図録 第42回企画展 大国近江の壮麗な国府 (財団法人滋賀県文化財保護協会調査成果展)
図録 第36回企画展 古代地方木簡の世紀 文字資料から見た古代の近江 (財団法人滋賀県文化財保護協会調査成果展)
図録 特別展 戦国の城 安土城への道 (特別史跡安土城跡発掘調査20周年記念)
図録 第57回企画展 収蔵品で語る城郭と考古 考古編・城郭編 2冊組 (開館25周年記念)
図録 特別展 大岩山銅鐸から見えてくるもの (第2回滋賀・大阪博物館連携企画「銅鐸を探る」)
図録 特別展 蒲生氏郷 戦国を駆け抜けた武将 (蒲生氏郷生誕450年記念)