寧處に遑あらず : 古墳時代の戦乱 : 平成11年度春季特別展
ムラの変貌 : 稲作と弥生文化 : 証される農耕集落 : 平成10年度春季特別展
是非に及ばず : 本能寺の変を考える : 平成13年度秋季特別展
平成12年度春季特別展 楽浪海中に倭人有り 二千年前の日本列島
共に一女子を立て 卑弥呼政権の成立 開館10周年記念・平成14年度春季特別展
日継知らす可き王無し : 継体大王の出現 : 平成15年度春季特別展
物と人 古墳時代の生産と運搬 平成9年度春季特別展 開館5周年記念
日継知らす可き王無し : 継体大王の出現 : 平成15年度春季特別展
室町最後の将軍 : 足利義昭と織田信長 : 平成22年度秋季特別展
図録 第56回企画展 近世の江戸を掘る (開館25周年記念)
信長の城・秀吉の城 : 織豊系城郭の成立と展開 : 平成18年度秋季特別展
日は人作り、夜は神作る : 前方後円墳の出現と展開 : 平成十六年度春季特別展
信長×信玄 : 戦国のうねりの中で : 開館20周年記念・平成24年度秋季特別展
水中考古学の世界 びわこ湖底の遺跡を掘る 第38回企画展図録
韓国より渡り来て : 古代国家の形成と渡来人 : 平成十三年度春季特別展
ムラの変貌 : 稲作と弥生文化 : 証される農耕集落 : 平成10年度春季特別展
図録 特別展 戦国の城 安土城への道 (特別史跡安土城跡発掘調査20周年記念)
仏法の初め、_ (これ) より作 (おこ) れり : 古墳から古代寺院へ : 平成20年度春季特別展
物と人 : 古墳時代の生産と運搬 : 平成9年度春季特別展 : 開館五周年記念 正誤表付
暮らしが生んだ絶景 琵琶湖 水辺の文化的景観「開館20周年記念・第45回企画展」